Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm6aO70546 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6aO70546 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6aO70546 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms