Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr1O70481 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr1O70481 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ubr1O70481 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ubr1O70481 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr1O70481 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr1O70481 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr1O70481 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr1O70481 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubr1O70481 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ubr1O70481 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ubr1O70481 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubr1O70481 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubr1O70481 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubr1O70481 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ubr1O70481 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr1O70481 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr1O70481 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr1O70481 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr1O70481 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr1O70481 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr1O70481 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr1O70481 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr1O70481 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr1O70481 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr1O70481 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr1O70481 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms