Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OtogO55225 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtogO55225 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtogO55225 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtogO55225 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtogO55225 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtogO55225 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtogO55225 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtogO55225 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtogO55225 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtogO55225 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtogO55225 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtogO55225 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtogO55225 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtogO55225 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtogO55225 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtogO55225 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OtogO55225 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtogO55225 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtogO55225 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtogO55225 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtogO55225 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtogO55225 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OtogO55225 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtogO55225 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtogO55225 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtogO55225 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtogO55225 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtogO55225 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtogO55225 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtogO55225 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms