Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms