Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr2O55101 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms