Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema6bO54951 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema6bO54951 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema6bO54951 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema6bO54951 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema6bO54951 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema6bO54951 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema6bO54951 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema6bO54951 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sema6bO54951 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms