Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limk2O54785 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limk2O54785 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limk2O54785 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limk2O54785 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limk2O54785 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms