Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp15O54732 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp15O54732 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp15O54732 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms