Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cavin1O54724 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms