Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EdaO54693 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EdaO54693 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EdaO54693 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EdaO54693 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EdaO54693 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EdaO54693 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EdaO54693 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EdaO54693 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EdaO54693 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EdaO54693 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EdaO54693 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EdaO54693 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EdaO54693 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EdaO54693 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EdaO54693 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EdaO54693 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EdaO54693 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EdaO54693 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EdaO54693 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EdaO54693 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EdaO54693 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EdaO54693 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EdaO54693 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EdaO54693 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EdaO54693 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EdaO54693 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EdaO54693 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EdaO54693 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EdaO54693 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EdaO54693 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EdaO54693 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EdaO54693 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EdaO54693 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EdaO54693 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EdaO54693 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EdaO54693 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EdaO54693 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EdaO54693 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EdaO54693 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms