Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1aO35526 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms