Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KeraO35367 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KeraO35367 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KeraO35367 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KeraO35367 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KeraO35367 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KeraO35367 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KeraO35367 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KeraO35367 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KeraO35367 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KeraO35367 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KeraO35367 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KeraO35367 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KeraO35367 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KeraO35367 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KeraO35367 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KeraO35367 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KeraO35367 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KeraO35367 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KeraO35367 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms