Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Ptpn9O35239 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn9O35239 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Ptpn9O35239 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Ptpn9O35239 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Ptpn9O35239 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Ptpn9O35239 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Ptpn9O35239 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn9O35239 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms