Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf11O35235 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf11O35235 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms