Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad6O35182 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad6O35182 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smad6O35182 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad6O35182 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad6O35182 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad6O35182 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad6O35182 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad6O35182 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad6O35182 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms