Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn4O35054 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn4O35054 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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