Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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H2-Q1O19441 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Q1O19441 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Q1O19441 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Q1O19441 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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H2-Q1O19441 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Q1O19441 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Q1O19441 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Q1O19441 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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H2-Q1O19441 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-Q1O19441 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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H2-Q1O19441 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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H2-Q1O19441 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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H2-Q1O19441 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-Q1O19441 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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