Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltbp2O08999 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltbp2O08999 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ltbp2O08999 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ltbp2O08999 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms