Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp12O08736 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp12O08736 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp12O08736 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp12O08736 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp12O08736 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp12O08736 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp12O08736 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms