Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms