Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh11O08638 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh11O08638 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh11O08638 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myh11O08638 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myh11O08638 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms