Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna3O08545 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna3O08545 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna3O08545 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efna3O08545 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms