Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20878L7N244 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20878L7N244 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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