Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20939L7N243 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms