Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp955bL7N232 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp955bL7N232 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms