Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccer2J3QPU5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms