Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2035J3QP87 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm2035J3QP87 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms