Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9242J3QNY1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9242J3QNY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9242J3QNY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9242J3QNY1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9242J3QNY1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9242J3QNY1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms