Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim18J3QNP2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms