Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Top6blJ3QMY9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Top6blJ3QMY9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Top6blJ3QMY9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top6blJ3QMY9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Top6blJ3QMY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Top6blJ3QMY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top6blJ3QMY9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms