Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3415J3QMS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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