Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h12bG3X9I7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms