Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim55G3X8Y1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim55G3X8Y1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms