Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20517G3UVU6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20517G3UVU6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms