Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r76F8VQ63 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r76F8VQ63 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r76F8VQ63 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms