Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm2564F6Z9S8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2564F6Z9S8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm2564F6Z9S8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm2564F6Z9S8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm2564F6Z9S8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm2564F6Z9S8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm2564F6Z9S8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2564F6Z9S8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2564F6Z9S8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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