Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Crocc2F6XLV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Crocc2F6XLV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Crocc2F6XLV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms