Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28305F6U473 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms