Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm9887F6RFI0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9887F6RFI0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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