Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prl3d2F6R3P9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prl3d2F6R3P9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms