Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29094F6Q785 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29094F6Q785 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms