Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa35E9QLQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Defa35E9QLQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Defa35E9QLQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa35E9QLQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms