Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc7bE9Q9Y3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms