Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3hdm1E9Q9Q2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3hdm1E9Q9Q2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms