Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdhr2E9Q7P9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdhr2E9Q7P9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdhr2E9Q7P9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms