Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp31E9Q6Y8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp31E9Q6Y8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms