Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb9E9Q5G2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb9E9Q5G2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms