Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd2E9Q5F9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd2E9Q5F9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd2E9Q5F9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd2E9Q5F9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 643.5 ms