Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
BC005561E9Q5E2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BC005561E9Q5E2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BC005561E9Q5E2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms