Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krtap11-1E9Q2E9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms